雌激素是卵巢排分泌的，当时引起女性雌激素低的原因很多。
首先想到的当然是卵巢的功能不良的原因，卵巢先天发育异常，多囊卵巢，卵巢肿瘤等等引起排卵异常，雌激素水平低。所以这种情况就要根据具体情况，对症治疗。
1.卵巢先天发育不良，这是先天性的，一般是女性生殖器官都发育不良，可以有原发性闭经。这种情况只能外源性补充雌孕激素，促生殖器官发育，诱发月经来潮。
2.多囊卵巢，多囊卵巢是因为卵泡不发育保持在很小的状态，使得雌激素水平一直处于低水平状态，这种情况要治疗多囊卵巢综合症，治疗的原则是调整月经，促排卵，如果睾酮高，先要降睾酮，吃达英35，降低睾酮调整月经，激素水平正常，月经正常后，有生育要求，可以按照步骤，行促排治疗。
3. 卵巢肿瘤，由于卵巢肿瘤的原因，正常的卵巢皮质组织被破坏，不能正常排卵，引起雌激素低，这种情况要对卵巢肿瘤进行治疗，手术剥除，卵巢重建等等。病灶切除了，留下来的正常卵巢组织就可以行使其排卵的功能了，雌激素也会正常了。
除了卵巢的原因，还有控制卵巢排卵的垂体如果发生了病变也会影响排卵雌激素低怎么办，如垂体功能低下，不能刺激卵巢排卵，垂体有病变，垂体瘤等等。还有高泌乳素症。
垂体病变也是要对症治疗雌激素低怎么办，吃药或者是手术治疗。
